La investigación en Matemáticas es una actividad fundamental tanto por su valor propio como por su necesidad en prácticamente todos los avances de carácter científico. La Universidad de Cantabria cuenta con un potente elenco de científicos que están de actualidad como es el caso de Francisco Santos que ha sido galardonado con el Premio Humboldt, galardón que con anterioridad se ha concedido a casi 50 Premios Nobel, y el prestigioso Premio Fulkerson 2015, concedido por la Mathematical Optimization Society y la American Mathematical Society (http://elpais.com/elpais/2015/07/13/ciencia/1436778622_669194.html).

Destacan también Carlos Beltrán y Luis Miguel Pardo que consiguieron solucionar el "problema 17" de la famosa lista propuesta por Stephen Smale como los "retos matemáticos del Siglo XXI". Beltrán obtuvo el Premio Smale 2014 de la Society for the Foundations of Computational Mathematics, compartido con M. Braverman  (https://www.fing.edu.uy/eventos/focm2014/smale.html).

La investigación matemática en la Universidad de Cantabria incluye aspectos a la vez básicos y aplicados destacando además, en este último caso, la colaboración en empresas para el desarrollo de proyectos relacionados con la criptografía, la meteorología, la logística, la fabricación mecanizada de piezas, o el diseño del sistema de una central nuclear.

La Universidad de Cantabria muestra también su compromiso con la divulgación de esta disciplina con la organización de programas de estimulación del talento matemático como ESTALMAT, concursos como la Olimpiada Matemática Española y ciclos de conferencias para público general como Matemáticas en Acción. En este ciclo (de asistencia abierta) se explica cada dos semanas, a un nivel asequible, cómo las matemáticas son fundamentales para resolver multitud de problemas industriales, logísticos y de todo tipo. Las conferencias son impartidas por investigadores y profesionales de primera línea como Raúl Fernandez, del IBBTEC, que presentó la conferencia Matemáticas de la vida: nuevas fronteras en Biología de Sistemas, o Antonio Martos, de Dogram, quien expuso sobre Modelado matemático en fotografía y sistemas de visión tridimensional.